氯霉素可抑制原核生物的蛋白质合成，其原因是 A. 特异地抑制肽链延长因子2(EFT2)的活性B. 与核蛋白体的大亚基结合，抑制转肽酶活性，而阻断翻译延长过程C. 活化一种蛋白激酶，从而影响起动因子(1磷酸化D. 间接活化一种核酸内切酶使mRNA降解E. 阻碍氨基酰tRNA与核蛋白体小亚基结合

步骤 1：理解氯霉素的作用机制
氯霉素是一种广谱抗生素，它通过与核糖体的大亚基结合，从而抑制蛋白质合成过程中的转肽酶活性，阻止肽链的延伸，进而阻断翻译过程。

步骤 2：分析选项
A. 特异地抑制肽链延长因子2(EFT2)的活性：氯霉素的作用机制并不是通过抑制肽链延长因子2的活性来实现的。
B. 与核蛋白体的大亚基结合，抑制转肽酶活性，而阻断翻译延长过程：这是氯霉素的作用机制，它通过与核糖体的大亚基结合，抑制转肽酶活性，从而阻止肽链的延伸。
C. 活化一种蛋白激酶，从而影响起动因子(1磷酸化：氯霉素的作用机制并不涉及蛋白激酶的活化。
D. 间接活化一种核酸内切酶使mRNA降解：氯霉素的作用机制并不涉及mRNA的降解。
E. 阻碍氨基酰tRNA与核蛋白体小亚基结合：氯霉素的作用机制并不涉及氨基酰tRNA与核糖体小亚基的结合。

步骤 3：选择正确答案
根据以上分析，氯霉素的作用机制是与核糖体的大亚基结合，抑制转肽酶活性，从而阻止肽链的延伸，因此正确答案是B。