自发裂变：核裂变：诱发裂变A. 波浪能：太阳能：可再生能源B. 铁路交通：现代交通：公路交通C. 贸易逆差：贸易平衡：贸易顺差D. 负有理数：负实数：负无理数

步骤 1：理解题干逻辑关系
题干中的“自发裂变”、“核裂变”和“诱发裂变”是按照某种逻辑关系排列的。其中，“核裂变”是总称，而“自发裂变”和“诱发裂变”是其两种不同的类型。因此，题干的逻辑关系是：总称与两种类型的分类关系。

步骤 2：分析选项逻辑关系
A. 波浪能：太阳能：可再生能源
波浪能和太阳能都是可再生能源的类型，但它们之间没有总称与分类的关系。
B. 铁路交通：现代交通：公路交通
铁路交通和公路交通都是现代交通的类型，但它们之间没有总称与分类的关系。
C. 贸易逆差：贸易平衡：贸易顺差
贸易逆差、贸易平衡和贸易顺差是贸易状态的三种情况，但它们之间没有总称与分类的关系。
D. 负有理数：负实数：负无理数
负有理数和负无理数都是负实数的类型，负实数是总称，负有理数和负无理数是其两种不同的类型，符合题干的逻辑关系。

步骤 3：选择正确答案
根据以上分析，选项D符合题干的逻辑关系，即总称与分类的关系。